فقدان الانتروبيا التوافقية هو مساهمة كبيرة في الديناميكا الحرارية لطي البروتينومع ذلك ، فقد ثبت أن التحديد الدقيق للكمية يمثل تحديًا. نحسب هذه الخسارة باستخدام عمليات المحاكاة الديناميكية الجزيئية لكل من البروتين الأصلي ومجموعة الحالة الواقعية المشوهة.
ما هو بروتين الانتروبيا التوافقية؟
الانتروبيا التوافقية هي الانتروبيا المرتبطة بعدد مطابقة الجزيء. … في البروتينات ، تُستخدم زوايا العمود الفقري ثنائية السطوح ودوارات السلسلة الجانبية بشكل شائع كمعلمات ، وفي RNA يمكن استخدام نمط الاقتران الأساسي.
أيهما يحتوي على أكبر قدر من الانتروبيا التوافقية بروتين مطوي أم بروتين مكشوف؟
الانتروبيا التوافقية لسلسلة البولي ببتيد أكبر بالنسبة الحالة غير المطوية مقارنة بالحالة المطوية الأكثر إحكاما التي تتميز بمساحة توافقية أكثر تقييدًا. لذلك ، تعمل هذه المساهمة على استقرار الحالة غير المطوية (ΔSconf> 0).
ما الذي يحدد تكوين البروتين وما هي المشكلة المرتبطة بطي البروتين؟
الهيكل الأساسي للبروتين ، تسلسله الأحماض الأمينية الخطية، يحدد شكله الأصلي. تعتبر بقايا الأحماض الأمينية المحددة وموضعها في سلسلة البولي ببتيد هي العوامل المحددة التي يتم من خلالها طي أجزاء من البروتين معًا بشكل وثيق وتشكيل شكلها ثلاثي الأبعاد.
ما هي العوامل التي تؤثر على طي البروتين؟
طي البروتين عملية حساسة للغاية تتأثر بالعديد من العوامل الخارجية بما في ذلك المجالات الكهربائية والمغناطيسية ودرجة الحرارة ودرجة الحموضة والمواد الكيميائية ومحدودية المساحة والتزاحم الجزيئي تؤثر هذه العوامل على قدرة البروتينات على الانطواء إلى أشكالها الوظيفية الصحيحة.
