Logo ar.boatexistence.com

ما هو ملف bigwig؟

جدول المحتويات:

ما هو ملف bigwig؟
ما هو ملف bigwig؟

فيديو: ما هو ملف bigwig؟

فيديو: ما هو ملف bigwig؟
فيديو: Understanding File Formats in Bioinformatics: ChIP-Seq files - BigWig (Wiggle) and BED/bigBed 2024, يونيو
Anonim

BigWig هو تنسيق ملف لعرض بيانات كثيفة ومستمرة في مسار متصفح الجينوم، تم إنشاؤه عن طريق التحويل من تنسيق Wiggle (WIG). يتم وصف تنسيق BigWig في موقع ويب UCSC Genome Bioinformatics ، ويوفر دليل تنسيق ملف Broad Institute معلومات إضافية.

ما هو تنسيق bigWig؟

تنسيق bigWig هو لعرض البيانات الكثيفة والمستمرة التي سيتم عرضها كرسم بيانييتم إنشاء ملفات BigWig مبدئيًا من ملفات نوع WIG ، باستخدام برنامج UCSC wigToBigWig. بدلاً من ذلك ، يمكن إنشاء ملفات bigWig من ملفات bedGraph ، باستخدام bedGraphToBigWig ببرنامج UCSC.

كيف يمكنني استخدام ملف bigWig؟

انقل ملف bigWig الذي تم إنشاؤه حديثًا (myBigWig.bw) إلى http أو httpsأو موقع بروتوكول نقل الملفات يمكن الوصول إليه عبر الويب. الصق عنوان URL في نموذج إدخال المسار المخصص أو أنشئ مسارًا مخصصًا باستخدام خط مسار واحد. الصق خط المسار المخصص في مربع النص على صفحة إدارة المسار المخصص.

ما هو المسار الكبير؟

مسارات bigWig هي مسارات للإشارات المستمرة عبر الجينوم بأكمله. إنها مناسبة لعرض نتائج تجارب "خام" متنوعة مثل إشارات ChIP-Seq وإشارات RNA-Seq وما إلى ذلك.

كيف يمكنني إنشاء ملف bigWig؟

هناك عدة طرق لإنشاء ملفات كبيرة الحجم. هذا عادة ما ينطوي على تحويل ملف. ملف bam إلى مسار تذبذب (. شعر مستعار) ثم تحويل مسار التذبذب إلى ملف ثنائي مهم (.

موصى به: