Logo ar.boatexistence.com

لماذا محاذاة التسلسل المتعدد؟

جدول المحتويات:

لماذا محاذاة التسلسل المتعدد؟
لماذا محاذاة التسلسل المتعدد؟

فيديو: لماذا محاذاة التسلسل المتعدد؟

فيديو: لماذا محاذاة التسلسل المتعدد؟
فيديو: محاذاة التتابع Sequence Alignment 2024, يمكن
Anonim

المحاذاة التسلسلية المتعددة توفر معلومات أكثر من المحاذاة الزوجية لأنها تُظهر مناطق محفوظة داخل عائلة بروتينيةذات أهمية هيكلية ووظيفية.

ما هو الغرض من إجراء محاذاة متعددة التسلسل؟

نظرًا لمجموعة من المتواليات البيولوجية (RNA ، البروتينات ، DNA) ، فإن الغرض من طريقة MSA هو لمحاذاة التسلسلات بطريقة تعكس إما علاقتها التطورية أو الوظيفية أو الهيكلية(الشكل 1).

كيف تساعد محاذاة التسلسل المتعدد في التطور؟

يتم استخدام التسلسلات المحاذية للعديد من الأغراض ، بما في ذلك تقدير أنماط الاختلاف ، والاختيار، وتيرة وطريقة التغيير التطوري ، وتحديد العناصر والقيود الوظيفية ، والتاريخ الوراثي ، على سبيل المثال لا الحصر.

هل محاذاة التسلسل المتعدد؟

محاذاة التسلسل المتعدد (MSA) هي بشكل عام محاذاة ثلاثة متواليات بيولوجية أو أكثر (بروتين أو حمض نووي) ذات طول مماثلمن المخرجات ، يمكن استنتاج التماثل و العلاقات التطورية بين المتواليات المدروسة. … أداة MSA سريعة جدًا تركز على المناطق المحلية.

كيف يتم إنشاء محاذاة التسلسل المتعدد؟

تنتج خوارزمية Clustal Omega محاذاة تسلسلية متعددة بواسطة أولاً إنتاج محاذاة زوجية باستخدام طريقة k-tupleثم ، يتم تجميع التسلسلات باستخدام طريقة mBed. يتبع ذلك طريقة التجميع k-mean. يتم إنشاء شجرة الدليل بعد ذلك باستخدام طريقة UPGMA.

موصى به: